Los 22 clasificados de la primera fase y los 10 equipos provenientes de la Libertadores 2018 (dos de la ronda final de repechaje y los ocho terceros de la fase de grupos), disputaran esta segunda fase de la Sudamericana. Así quedaron los cruces:

 O1 General Díaz Vs Millonarios FC

O2 Nacional de Paraguay Vs Botafogo

O3 Sol de América Vs Nacional de Uruguay

O4 Sao Paulo Vs Colón

O5 Boston River Vs Club Atlético Banfield

O6 Fluminense Vs Defensor Sporting

O7 Atlético Paranaense Vs Peñarol

O8 Deportivo Cali Vs Bolivar

O9 Liga de Quito Vs Vasco da Gama

O10 Caracas Vs Sport Huancayo

O11 Deportivo Cuenca Vs Jorge Wiltersmann

O12 Defensa y Justicia Vs El Nacional

O13 Lanús Vs Atlético Junior

O14 San Lorenzo Vs deportes Temuco

O15 Bahía Vs Atletico Cerro

O16 Rampla Juniors Vs Independiente Santa Fe

METODOLOGÍA:

Los equipos fueron ubicados en dos bombos:

1. Bombo 1: 10 equipos procedentes de la Copa Libertadores más los 6 equipos de mejor actuación en la primera fase de la Sudamericana.
2. Bombo 2: Los 16 equipos restantes clasificados.
3. Del bolillero 2 ( conformado por el bombo 2) se extrajeron 16 bolillas que conformaron llaves de O1 a O16. Posteriormente del bolillero 1 (bombo 1) se extrajeron las bolillas con los equipos que completaron las llaves, definiéndose así los cruces para la segunda fase.

IMPORTANTE:

1. La localía en el primer partido corresponderá a los equipos del bombo 2. Así las cosas, Millonarios comienza en condición de visita y cierra de local.
2. Para las fases siguientes, y hasta la FINAL inclusive, la localía en los partidos estará supeditada a la numeración que cada equipo obtenga en el orden de ubicación de sus llaves en el sorteo.